MINISTÈRE DE L’ÉDUCATION NATIONALE

 

ECOLE PRATIQUE DES HAUTES-ÉTUDES

 

Sciences de la Vie et de la Terre

 

 

 

 

MÉMOIRE

 

Présenté

par

 

Jean-Marc THIRION

 

Pour l’obtention du diplôme de l’École Pratique des Hautes Études

 

 

Le Pélobate cultripède Pelobates cultripes (Cuvier, 1829)
sur la façade atlantique française :
chorologie, écologie et conservation

 

 

 

 

 

 

       Soutenue le 1er février 2006 devant le jury suivant :

 

Roger PRODON                                     Président

Claude-Pierre GUILLAUME                  Rapporteur

Bernard LE GARFF                                Examinateur

Pierre-André CROCHET                         Examinateur

 

 

 

 

 

Laboratoire de Biogéographie et Écologie des Vertébrés

de l’École Pratique des Hautes Études

Directeur : Pr. Roger PRODON


Encadrement scientifique : MM. Raymond DUGUY (Musée Océanographique – La Rochelle) et Bernard LE GARFF (bernard.le-garff@univ-rennes1.fr )

Tutorat pédagogique EPHE : M. Claude-P. GUILLAUME (ephebev@univ-montp2.fr )

 

Résumé :

 

 

Le Pélobate cultripède est un Amphibien aux mœurs fouisseuses de la famille des Pélobatidés comptant un seul genre propre à la région Paléarctique, Pelobates. Le Pélobate cultripède a une répartition localisée au sud-ouest de l'Europe : Portugal, Espagne, sud et sud-ouest de la France. A l'ouest, sa répartition française est située uniquement sur la façade littorale atlantique (Gironde, Charente-Maritime, Vendée) remontant jusqu'à la hauteur de la Presqu'île de Guérande où il n'aurait pas été revu depuis 1994. Le Pélobate cultripède est en déclin sur l’ensemble de son aire de répartition. Cette espèce au statut précaire a peu été étudiée en France. C’est pour cette raison que nous avons entrepris une étude sur la répartition et le statut du Pélobate cultripède sur la façade atlantique française ainsi que sur l’écologie d’une population de la réserve naturelle du Marais d’Yves en vue d’appliquer une gestion conservatoire. Pour cela, nous avons effectué une approche à trois échelles : échelle continentale qui correspond à la répartition du Pélobate cultripède en France caractérisée par la géographie, l’orographie et la climatologie ; l’échelle régionale qui est définie par la répartition passée et actuelle de l’espèce dans les départements bordant le littoral atlantique français de la Loire-Atlantique aux Landes ; et l’échelle du secteur qui est représentée par l’ensemble des habitats de la réserve naturelle du Marais d’Yves pour définir les paramètres écologiques de la population.

 

Sur le littoral atlantique français, le Pélobate cultripède accuse une forte régression avec 41 % de stations qui ont disparu. Sur ce secteur, son aire de répartition est actuellement très fragmentée. En France, l’aire de répartition du Pélobate cultripède est caractérisée par un climat de type méditerranéen. La phénologie de la population de Pélobates cultripèdes sur la réserve naturelle du Marais d’Yves est marquée par deux saisons de fortes activités, le printemps et l’automne. Ainsi, l’activité de l’espèce est influencée par la température (préférendum entre 14 °C et 17 °C), la pluviométrie, l’hygrométrie et l’intensité lumineuse de la lune. Notre suivi de la population de Pélobates cultripèdes de la réserve naturelle du Marais d’Yves montre une fluctuation importante de ces effectifs suite au raz de marée du 27 décembre 1999. L’accroissement de notre population dépend des bonnes années de reproduction. La sex-ratio moyenne de la population présente un léger déséquilibre en faveur des femelles (61 %). La population se caractérise par un dimorphisme sexuel pour la taille et le poids et ce, en faveur des femelles. Nous avons également noté une corrélation significative entre le poids et la longueur museau-cloaque (r² = 0,906). Nous avons également observé que le Pélobate cultripède est une espèce peu mobile avec une distance moyenne journalière de 15 mètres, un domaine vital moyen de 15 m² (polygones convexes minimum) et des recaptures après une année à moins de vingt mètres de la première capture. Sur la réserve naturelle du Marais d’Yves, la distribution spatiale du Pélobate cultripède est de type contagieux en raison des caractéristiques du milieu.
Le Pélobate cultripède est localisé préférentiellement sur les cordons sableux à végétation rase et au recouvrement faible. Les populations d’adultes en phase terrestre se trouvent à proximité des habitats de reproduction qui sont aussi bien en eau permanente ou temporaire, avec une salinité de 1 à 7 ‰, un biovolume de macrophyte faible et sans poissons carnassiers. Le raz de marée a engendré un rajeunissement des habitats terrestres et aquatiques qui sont de ce fait plus favorables au Pélobate cultripède. Sur l’ensemble des stations françaises du Pélobate cultripède, le maintien des populations passe par la mise en place d’une mesure de protection accompagnée par une gestion conservatoire.


TABLE DES MATIÈRES

REMERCIEMENTS........................................................................... Erreur ! Signet non défini.

TABLE DES MATIÈRES.................................................................................................................. 4

TABLE DES FIGURES...................................................................... Erreur ! Signet non défini.

TABLE DES TABLEAUX.................................................................. Erreur ! Signet non défini.

INTRODUCTION GÉNÉRALE.......................................................... Erreur ! Signet non défini.

Bibliographie de l’introduction......................................................... Erreur ! Signet non défini.

CHAPITRE 1        PRÉSENTATION DE L’ESPÈCE, DU SITE D’ÉTUDE ET APPROCHE GÉNÉRALE DE LA MÉTHODE                            Erreur ! Signet non défini.

1.1.       Présentation du Pélobate cultripède..................................... Erreur ! Signet non défini.

1.2.       Description............................................................................. Erreur ! Signet non défini.

1.3.       Habitats................................................................................. Erreur ! Signet non défini.

1.4.       Biologie................................................................................. Erreur ! Signet non défini.

1.5.       Tendances et menaces............................................................. Erreur ! Signet non défini.

1.6.       Présentation de la réserve naturelle du Marais d’Yves......... Erreur ! Signet non défini.

1.6.1.    Localisation.............................................................................. Erreur ! Signet non défini.

1.6.2.    Historique................................................................................. Erreur ! Signet non défini.

1.6.3.    Milieu naturel............................................................................ Erreur ! Signet non défini.

1.6.4.    Climatologie............................................................................. Erreur ! Signet non défini.

1.6.5.    Géomorphologie et Géologie........................................................ Erreur ! Signet non défini.

1.6.6.    Pédologie.................................................................................. Erreur ! Signet non défini.

Trois types de sols sont trouvés dans la réserve (Fig. 22) :......................... Erreur ! Signet non défini.

1.6.7.    Réseau hydraulique..................................................................... Erreur ! Signet non défini.

1.6.8.    Analyse à différentes échelles........................................................ Erreur ! Signet non défini.

1.7.       Recherche du Pélobate cultripède.......................................... Erreur ! Signet non défini.

Bibliographie du chapitre 1................................................................. Erreur ! Signet non défini.

CHAPITRE 2        STATUT PASSÉ ET ACTUEL SUR LA FAÇADE ATLANTIQUE FRANÇAISE, CHOROLOGIE ET MENACES           Erreur ! Signet non défini.

2.1.       Introduction.......................................................................... Erreur ! Signet non défini.

2.2.       Méthodologie........................................................................ Erreur ! Signet non défini.

2.3.       Résultats............................................................................... Erreur ! Signet non défini.

2.3.1.    Historique des connaissances....................................................... Erreur ! Signet non défini.

2.3.1.1.     Loire-Atlantique................................................................. Erreur ! Signet non défini.

2.3.1.2.     Vendée............................................................................. Erreur ! Signet non défini.

2.3.1.3.     Charente-Maritime.............................................................. Erreur ! Signet non défini.

2.3.1.4.     Gironde............................................................................ Erreur ! Signet non défini.

2.3.1.5.     Landes.............................................................................. Erreur ! Signet non défini.

2.3.1.6.     Autres mentions................................................................. Erreur ! Signet non défini.

2.3.2.    Bilan, Statut et Menaces.............................................................. Erreur ! Signet non défini.

2.3.3.    Répartition en France................................................................. Erreur ! Signet non défini.

2.3.4.    Le Climat................................................................................. Erreur ! Signet non défini.

2.3.4.1.     Température de juillet.......................................................... Erreur ! Signet non défini.

2.3.4.2.     Température de janvier......................................................... Erreur ! Signet non défini.

2.3.4.3.     Amplitude thermique annuelle.............................................. Erreur ! Signet non défini.

2.3.4.4.     Ensoleillement................................................................... Erreur ! Signet non défini.

2.3.4.5.     Gelée................................................................................ Erreur ! Signet non défini.

2.3.4.6.     Précipitation...................................................................... Erreur ! Signet non défini.

2.3.5.    Altitude.................................................................................... Erreur ! Signet non défini.

2.3.6.    Discussion................................................................................ Erreur ! Signet non défini.

Bibliographie du chapitre 2................................................................. Erreur ! Signet non défini.

CHAPITRE 3        PHÉNOLOGIE DU RYTHME D’ACTIVITÉ DE LA POPULATION DE PÉLOBATE CULTRIPÈDE DE LA RÉSERVE NATURELLE DU MARAIS D’YVES........................................................................... 7

3.1.       Introduction.......................................................................... Erreur ! Signet non défini.

3.2.       Méthodologie........................................................................ Erreur ! Signet non défini.

3.3.       Résultats............................................................................... Erreur ! Signet non défini.

3.3.1.    Phénologie................................................................................ Erreur ! Signet non défini.

3.3.2.    Proposition d’un cycle annuel....................................................... Erreur ! Signet non défini.

3.3.3.    Température.............................................................................. Erreur ! Signet non défini.

3.3.4.    Température et pluviométrie......................................................... Erreur ! Signet non défini.

3.3.5.    Température et hygrométrie.......................................................... Erreur ! Signet non défini.

3.3.6.    Vent......................................................................................... Erreur ! Signet non défini.

3.3.7.    Lune........................................................................................ Erreur ! Signet non défini.

3.4.       Discussion............................................................................... Erreur ! Signet non défini.

Bibliographie du chapitre 3................................................................. Erreur ! Signet non défini.

CHAPITRE 4        CARACTÉRISTIQUES DE LA POPULATION DE PÉLOBATE CULTRIPÈDE DE LA RÉSERVE NATURELLE DU MARAIS D’YVES.................................................................................................. 8

4.1.       Introduction.......................................................................... Erreur ! Signet non défini.

4.2.       Méthodologie........................................................................ Erreur ! Signet non défini.

4.2.1.    Taille de la population................................................................ Erreur ! Signet non défini.

4.2.2.    Accroissement de la population..................................................... Erreur ! Signet non défini.

4.2.3.    Sex-ratio................................................................................... Erreur ! Signet non défini.

4.2.4.    Âge ratio.................................................................................. Erreur ! Signet non défini.

4.2.5.    Aspects biométriques................................................................... Erreur ! Signet non défini.

4.3.       Résultats............................................................................... Erreur ! Signet non défini.

4.3.1.    Taille de la population................................................................ Erreur ! Signet non défini.

4.3.2.    Accroissement de la population..................................................... Erreur ! Signet non défini.

4.3.3.    Sex-ratio................................................................................... Erreur ! Signet non défini.

4.3.4.    Âge-ratio.................................................................................. Erreur ! Signet non défini.

4.3.5.    Aspects biométriques de la population........................................... Erreur ! Signet non défini.

4.3.5.1.     Longueur museau-cloaque.................................................... Erreur ! Signet non défini.

4.3.5.2.     Poids............................................................................... Erreur ! Signet non défini.

4.3.5.3.     Dépendance des variables : longueur museau-cloaque et poids..... Erreur ! Signet non défini.

4.3.5.4.     Corpulence........................................................................ Erreur ! Signet non défini.

4.3.6.    Dimorphisme sexuel.................................................................... Erreur ! Signet non défini.

4.3.7.    Comparaison interpopulationnelle................................................ Erreur ! Signet non défini.

4.4.       Discussion............................................................................... Erreur ! Signet non défini.

4.4.1.    Taille de la population................................................................ Erreur ! Signet non défini.

4.4.2.    Sex-ratio................................................................................... Erreur ! Signet non défini.

4.4.3.    Âge-ratio.................................................................................. Erreur ! Signet non défini.

4.4.4.    Longueur museau-cloaque............................................................ Erreur ! Signet non défini.

4.4.5.    Poids....................................................................................... Erreur ! Signet non défini.

4.4.6.    Longueur museau-cloaque et poids................................................ Erreur ! Signet non défini.

4.4.7.    Corpulence................................................................................ Erreur ! Signet non défini.

4.4.8.    Dimorphisme sexuel.................................................................... Erreur ! Signet non défini.

Bibliographie du chapitre 4................................................................. Erreur ! Signet non défini.

CHAPITRE 5        DÉPLACEMENTS ET DOMAINE VITAL JOURNALIERS DE LA POPULATION DE PÉLOBATE CULTRIPÈDE DE LA RÉSERVE NATURELLE DU MARAIS D’YVES.............................................. 9

5.1.       Introduction.......................................................................... Erreur ! Signet non défini.

5.2.       Méthodologie........................................................................ Erreur ! Signet non défini.

5.3.       Résultats............................................................................... Erreur ! Signet non défini.

5.3.1.    Déplacements journaliers............................................................. Erreur ! Signet non défini.

5.3.2.    Domaines vitaux journaliers......................................................... Erreur ! Signet non défini.

5.3.2.1.     Polygone Convexe Minimum (Fig. 84).................................. Erreur ! Signet non défini.

5.3.2.2.     Kernel adaptative (Fig. 85)................................................... Erreur ! Signet non défini.

5.3.3.    Données temporelles................................................................... Erreur ! Signet non défini.

5.4.       Discussion............................................................................... Erreur ! Signet non défini.

Bibliographie du chapitre 5................................................................. Erreur ! Signet non défini.

CHAPITRE 6        DISTRIBUTION SPATIALE DE LA POPULATION DE PÉLOBATE CULTRIPÈDE DE LA RÉSERVE NATURELLE DU MARAIS D’YVES................................................................................................ 10

6.1.       Introduction.......................................................................... Erreur ! Signet non défini.

6.2.       Méthodologie........................................................................ Erreur ! Signet non défini.

6.2.1.    Cartographie des Pélobates......................................................... Erreur ! Signet non défini.

6.2.2.    Distribution spatiale................................................................... Erreur ! Signet non défini.

6.2.3.    L’occurrence.............................................................................. Erreur ! Signet non défini.

6.3.       Résultats............................................................................... Erreur ! Signet non défini.

6.3.1.    Distribution spatiale................................................................... Erreur ! Signet non défini.

6.3.2.    L’occurrence.............................................................................. Erreur ! Signet non défini.

6.4.       Discussion............................................................................... Erreur ! Signet non défini.

Bibliographie du chapitre 6................................................................. Erreur ! Signet non défini.

CHAPITRE 7        HABITAT TERRESTRE DE LA POPULATION DE PÉLOBATE CULTRIPÈDE DE LA RÉSERVE NATURELLE DU MARAIS D’YVES................................................................................................ 10

7.1.       Introduction.......................................................................... Erreur ! Signet non défini.

7.2.       Méthodologie........................................................................ Erreur ! Signet non défini.

7.2.1.    Préférendums d’habitat............................................................... Erreur ! Signet non défini.

7.2.2.    Analyse des micro habitats........................................................... Erreur ! Signet non défini.

7.3.       Résultats............................................................................... Erreur ! Signet non défini.

7.3.1.    Préférendums d’habitat............................................................... Erreur ! Signet non défini.

7.3.1.1.     Année 1999....................................................................... Erreur ! Signet non défini.

7.3.1.2.     Année 2000....................................................................... Erreur ! Signet non défini.

7.3.1.3.     Année 2002....................................................................... Erreur ! Signet non défini.

7.3.1.4.     Année 2003....................................................................... Erreur ! Signet non défini.

7.3.2.    Micro-habitats........................................................................... Erreur ! Signet non défini.

7.4.       Discussion............................................................................... Erreur ! Signet non défini.

Bibliographie du chapitre 7................................................................. Erreur ! Signet non défini.

CHAPITRE 8        HABITAT AQUATIQUE DE LA POPULATION DE PÉLOBATE CUTRIPÈDE DE LA RÉSERVE NATURELLE DU MARAIS D’YVES................................................................................................ 11

8.1.       Introduction.......................................................................... Erreur ! Signet non défini.

8.2.       Méthodologie........................................................................ Erreur ! Signet non défini.

8.2.1.    Régime de l’eau.......................................................................... Erreur ! Signet non défini.

8.2.2.    Salinité..................................................................................... Erreur ! Signet non défini.

8.2.3.    pH........................................................................................... Erreur ! Signet non défini.

8.2.4.    Distance à la première population................................................. Erreur ! Signet non défini.

8.2.5.    Végétation................................................................................. Erreur ! Signet non défini.

8.2.6.    Densité des têtards..................................................................... Erreur ! Signet non défini.

8.2.7.    Relation interspécifique............................................................... Erreur ! Signet non défini.

8.2.8.    Turn-over.................................................................................. Erreur ! Signet non défini.

8.2.9.    Analyse statistique...................................................................... Erreur ! Signet non défini.

8.3.       Résultat................................................................................ Erreur ! Signet non défini.

8.3.1.    Régime de l’eau.......................................................................... Erreur ! Signet non défini.

8.3.2.    Salinité..................................................................................... Erreur ! Signet non défini.

8.3.3.    pH........................................................................................... Erreur ! Signet non défini.

8.3.4.    Distance à la première population................................................. Erreur ! Signet non défini.

8.3.5.    Végétation................................................................................. Erreur ! Signet non défini.

8.3.6.    Relation interspécifique............................................................... Erreur ! Signet non défini.

8.3.7.    Turn-Over................................................................................. Erreur ! Signet non défini.

8.3.8.    Poisson.................................................................................... Erreur ! Signet non défini.

8.4.       Discussion............................................................................... Erreur ! Signet non défini.

Bibliographie du chapitre 8................................................................. Erreur ! Signet non défini.

CHAPITRE 9        GESTION CONSERVATOIRE DE LA POPULATION DE PÉLOBATE CULTRIPÈDE DE LA RÉSERVE NATURELLE DU MARAIS D’YVES............................................................................... 12

9.1.       Introduction.......................................................................... Erreur ! Signet non défini.

9.2.       Quelques aspects des traits de vie du Pélobate cultripède...... Erreur ! Signet non défini.

9.3.       L’évolution naturelle des habitats....................................... Erreur ! Signet non défini.

9.4.       Maintien en l’état.................................................................. Erreur ! Signet non défini.

9.4.1.    Pâturage................................................................................... Erreur ! Signet non défini.

9.4.2.    Le Lapin de garenne un élément majeur pour la biodiversité.............. Erreur ! Signet non défini.

9.5.       Restauration des habitats terrestres..................................... Erreur ! Signet non défini.

9.6.       Restauration des habitats aquatiques................................... Erreur ! Signet non défini.

Bibliographie du chapitre 9................................................................. Erreur ! Signet non défini.

BIBLIOGRAPHIE GÉNÉRALE......................................................... Erreur ! Signet non défini.

ANNEXE                                                                                            ............................................................................. Erreur ! Signet non défini.


STATUT PASSÉ ET ACTUEL SUR LA FAÇADE ATLANTIQUE FRANÇAISE, CHOROLOGIE ET MENACES

 

Le premier fossile du genre Pelobates, propre au Paléarctique (Laurent, 1986 ; Duellman & Trueb, 1994), est représenté au milieu de l’Eocène (Duellman & Trueb., 1994). Suite aux travaux de Busack et al. (1985) et de Garcia-Paris et al. (2003), il semblerait qu’il ait existé un taxon commun entre les espèces Pelobates cultripes et Pelobates varaldii dont la scission correspondrait à la fin du Miocène, peu avant la formation du détroit de Gibraltar à la frontière du Miocène et du Pliocène (Ibidem). Un fossile de Pelobates cultripes a été observé dans le Pliocène supérieur français (Bailon, 1991).

Durant le dernier pléniglaciaire (Würm), les populations du Pélobate cultripède auraient eu leurs aires de répartition circonscrites aux refuges ibériques (Lescure, 1984) à climat méditerranéen, dont celui de la région de Barcelone. Durant la transgression flandrienne, afin de gagner la France, l’espèce aurait traversé les Pyrénées par la Catalogne (Ibidem). Ainsi, une des premières mentions française post-Würm remonte à des restes fossiles collectés dans la grotte de l’Abeurador dans l’Hérault, lesquels dateraient du Tardiglaciaire final soit d'environ 8500 ans avant J.C. (moins probablement de 10500 ans avant J.-C.) (Bailon, 2003). Dans la vallée du Rhône, le Pélobate cultripède a atteint sa limite septentrionale dès le Néolithique moyen (3000‑3500 ans avant J.-C.) (Ibidem). A l’ouest les données sont plus fragmentaires, mais des restes de l’espèce ont été identifiés dans des silos médiévaux du 11ème ou 12ème siècle de la vallée de la Haute-Garonne (Ibidem). Cette dernière donnée accréditerait le fait que l’espèce serait remontée dans l’ouest par la vallée de la Garonne (Lescure, 1989) où de l’Isle l’a observée au XIXème siècle (Lataste, 1876).

Ainsi, le Pélobate cultripède a une répartition propre au sud-ouest de l'Europe : Portugal, Espagne, sud et sud-ouest de la France (Lizana, 1997). En France, il occupe, au sud, les régions méditerranéennes, des Pyrénées-Orientales à l'ouest à la région de Fréjus à l'est (Knoepffler, 1960, Chirio, 1976, Lescure, 1984, Geniez et Cheylan, 1987). A l'ouest, sa répartition se limite au littoral atlantique, jusqu'à la Presqu'île de Guérande au nord où il a été signalé pour la dernière fois, en 1994 par Montfort (1995 ; 1999).

Après plusieurs années de suivi des stations atlantiques françaises, on peut dresser un premier bilan des situations biogéographiques passée et actuelle de ces populations. Nous examinerons les menaces et la tendance des populations de Pélobates cultripèdes du littoral atlantique français.

Du fait que les conditions climatiques influencent la distribution géographique et l’écologie des Amphibiens ainsi que l’époque et l’intensité de la recherche de nourriture, de la reproduction et de la migration (Heyer et al., 1994), nous étudierons, à plus grande échelle, les facteurs climatiques et altitudinaux.

 

 

PHÉNOLOGIE DU RYTHME D’ACTIVITÉ DE LA POPULATION DE PÉLOBATE CULTRIPÈDE DE LA RÉSERVE NATURELLE DU MARAIS D’YVES

 

La phénologie est l’étude des variations des phénomènes périodiques de la vie en fonction du climat et des saisons (Le Garff, 1998). Le rythme d’activité est défini comme représentant les variations du comportement caractérisées par trois paramètres : la période, la fréquence et l’amplitude (McFarland, 1990).

Les conditions climatiques influencent la distribution géographique et l’écologie des Amphibiens ainsi que l’époque et l’intensité de la recherche de nourriture, de la reproduction et de la migration (Heyer et al., 1994). Elles affectent aussi les densités de population et les nombreuses interactions au sein des communautés (Ibidem).

Depuis longtemps déjà, certains auteurs ont mis en évidence l’action des facteurs climatiques sur les Amphibiens. Ainsi, Jean Rostand (1933) signalait au sujet du Crapaud commun : « L’état hygrométrique ou thermique influe également sur sa couleur. La sécheresse et la chaleur l’éclaircissent ; le froid et l’humidité le foncent… ».

Cette action des facteurs climatiques sur les Amphibiens résulte, en premier lieu, du fait qu'il s'agit d'animaux poïkilothermes dont la température du corps dépend des conditions environnementales (Griffiths, 1996). La température externe est l’un des facteurs les plus important qui influence l’activité des Amphibiens déterminant alors leur présence et leur abondance (Heyer et al., 1994). La température agit sur la période et la durée de la reproduction, sur la vitesse de développement des œufs et des larves, et sur la croissance postmétamorphique (Stebbins & Cohens, 1997) Dans le milieu aquatique, la température semble être le plus important de tous les paramètres physiques, celui qui engendre de nombreux effets sur la physiologie, l’écologie et le comportement des larves d’Amphibiens (McDiarmid & Altig, 2000). La température affecte également le chant des Amphibiens (Ryan, 2001). Le fait d’être poïkilotherme présente des avantages, tels que mieux résister à la diminution critique de la nourriture ou allouer une proportion importante de leur budget énergétique à la reproduction, en comparaison avec les homéothermes (Beebee & Griffiths, 2000). Le contrôle métabolique de la température chez les Amphibiens est faible (Stebbins & Cohens, 1997). Certains Amphibiens pour augmenter la température de leur corps thermorégulent, cependant le fait de thermoréguler entraîne un problème d’évaporation de l’eau (Duellman & Trueb, 1994). D’autres préfèrent s’enfouir notamment dans les régions arides (Katz et al., 1997). Et d’autres encore s’enveloppent de cire ou se fabriquent un cocon réduisant la perméabilité de leur peau (Ibidem).

Mis à part l’influence des paramètres climatiques sur l’activité de la reproduction du Pélobate cultripède (Diaz-Paniagua, 1986 ; Salvador et al., 1986 ; Salvidio et Quero, 1987 ; Lizana et al., 1994), aucune étude in natura n’a été réalisée sur la phénologie du rythme d’activité en phase terrestre de l’espèce en fonction des paramètres météorologiques.

Les questions que nous nous sommes posées concernant les Pélobates cultripèdes de la population de la réserve naturelle du Marais d'Yves étaient les suivantes :

 

-       Quel est leur rythme d’activité annuel ?

-       A quel moment se reproduisent-ils ?

-       Existe-t-il des périodes d'hivernage et d'estivation ?

-       Les paramètres météorologiques influent ils sur leur rythme ?

-       La lune a-t-elle une influence sur l’activité de l’espèce ?

 

 

CARACTÉRISTIQUES DE LA POPULATION DE PÉLOBATE CULTRIPÈDE DE LA RÉSERVE NATURELLE DU MARAIS D’YVES

 

La compréhension du fonctionnement démographique des populations revêt une importance capitale pour la gestion des milieux naturels (Joly, 2003). Ainsi, un des aspects du système population appréhende les caractéristiques populationnelles définie par des variables d’état : densité, structure d’âge, sex-ratio, distribution spatiale et autres qui sont modulées par les processus démographiques (natalité, mortalité, émigration, immigration) dépendant étroitement des interactions entre les propriétés de l’environnement où ils s’inscrivent et les propriétés des individus qui en sont le support (Barbault, 1995).

La dynamique des populations des Amphibiens est intéressante pour au moins deux raisons. La première, du fait d’une très grande diversité de stratégies démographiques, de la sélection “K” où peu de jeunes sont produits à la stratégie démographique extrême “r” où les jeunes sont produits par millier (Beebee, 1996). La seconde est le fait que les Amphibiens sont caractérisés par leur longévité au regard d’autres groupes comme les Mammifères ou les Oiseaux à taille similaire (Ibidem). Cette différence est due à l’ectothermie à l’encontre de l’endothermie, mais aussi du fait des toxines qu’utilisent les Amphibiens pour se défendre contre les prédateurs (Ibidem).

Les suivis de taille de population chez les Amphibiens, effectués en général par la technique de capture-marquage-recapture (C-M-R), sont utilisés par les herpétologues depuis les années 1920 (Heyer et al., 1994). Les méthodes de C-M-R sont très intéressantes dans les suivis de population du fait même qu’elles vont au-delà de la simple estimation de la taille en incluant des variables d’état (sexe-ratio, âge ratio…), des paramètres démographiques (natalité, mortalité, émigration, immigration et taux de survie), des paramètres spatiaux et des taux individuels de croissance (Ibidem).

A l’heure actuelle, en Europe, peu d’études concernent la dynamique des populations d’Amphibiens en phase terrestre. Ainsi, les suivis de dynamique de population du Pélobate cultripède n’ont-ils été réalisés que durant la période de reproduction (Salvador et al., 1986 ; Savidio et Quero, 1987 ; Lizana et al., 1994).

 

L’objectif de ce chapitre est d’estimer les variables d’état de la population étudiée ainsi que les caractères individuels biométriques sur la base des paramètres suivants :

 

 

 

DÉPLACEMENTS ET DOMAINE VITAL JOURNALIERS DE LA POPULATION DE PÉLOBATE CULTRIPÈDE DE LA RÉSERVE NATURELLE DU MARAIS D’YVES

 

 

Le suivi des déplacements animaux fournit de nombreuses informations relatives à la longueur et à la nature du déplacement, à la sélection du site de reproduction, à la dispersion, à la migration, au domaine vital et à l’habitat.

De nombreuses méthodes sont utilisées pour le suivi des déplacements de petits mammifères, comme le radiotracking ou l'enregistrement vidéo, mais ce sont les pigments fluorescents qui sont les plus précis, les plus faciles d’utilisation et les moins chers (Mullican & Streubel, 1989 ; Eggert et al., 1999). Les pigments fluorescents ont été utilisés dans l’analyse des déplacements des petits rongeurs et notamment pour l’étude de la dispersion des glands par Apodemus sylvaticus dans la chênaie méditerranéenne (Duplantier et al., 1984). Ainsi, le développement des suivis avec les pigments fluorescents a produit une dynamique dans les études des déplacements animaux (Lemen & Freeman, 1985).

Cette méthode a été également utilisée et testée chez les Amphibiens (Lodé, 1996 ; Eggert, 2000) et la comparaison technique de deux méthodes de suivi, radiotracking d’une part et pigments fluorescents d’autre part n'a montré aucune différence dans les résultats obtenus (Mullican, 1988).

Le suivi des déplacements permet de caractériser le domaine vital d’un individu. Cependant, en Europe l’étude des domaines vitaux des Amphibiens est encore fragmentaire.
Les principaux auteurs et les espèces concernées sont présentés ici : Joly (1966), Salamandre tachetée Salamandra salamandra
 ; Salvidio et al (1994), Spélèrpes d’Ambrosi Speleomantes ambrosii ; Denoël (1996), Salamandre tachetée Salamandra salamandra ; Catenazzi (1998), Salamandre tachetée Salamandra salamandra ; Ribéron & Miaud (2000), Salamandre de Lanza Salamandra lanzai ; Eggert (2000), Pélobate brun Pelobates fuscus ; Miaud & Sanuy (2005), Crapaud calamite Bufo calamita.

 

DISTRIBUTION SPATIALE DE LA POPULATION DE PÉLOBATE CULTRIPÈDE DE LA RÉSERVE NATURELLE DU MARAIS D’YVES

 

Dans un contexte mondial de déclin généralisé des Amphibiens (Wake et Morowitz, 1991), les suivis de répartition d’espèce à petite ou grande échelles sont d’une importance majeure en biologie de la conservation (Beebee, 1996).

A l’intérieur de chaque aire géographique, les plantes et les animaux sont distribués suivant trois modèles spatiaux : au hasard, contagieux ou uniforme (Krebs, 1999). Il est donc possible de caractériser de manière statistique le caractère plus ou moins régulier de la densité d’organismes par le mode de dispersion spatiale (Frontier & Pichod-Viale, 1995). Ainsi, l’étude de la distribution spatiale des populations est une démarche essentielle pour la compréhension des processus démo‑écologiques (Ramade, 2003).

Le suivi pluri annuel de la population de Pélobates cultripèdes sur la réserve naturelle du Marais d’Yves, nous a permis de mettre en place une cartographie annuelle de la répartition de l’espèce en phase terrestre. L’analyse de la distribution spatiale de l’espèce au sein de la réserve a été établie pour les quatre années suivantes : 1999, 2000, 2002 et 2003. Nous avons également réalisé une étude comparative de l’occurrence de l’espèce afin de mettre en évidence d’éventuels phénomènes de régression ou d’augmentation d’aire sur la réserve naturelle du Marais d’Yves.

 

 

HABITAT TERRESTRE DE LA POPULATION DE PÉLOBATE CULTRIPÈDE DE LA RÉSERVE NATURELLE DU MARAIS D’YVES

 

L’habitat se définit, par rapport à l’espèce, comme l’ensemble des éléments du biotope dont cette dernière se sert pour la satisfaction de ses besoins et, par extension, comme l’ensemble des biotopes où l’espèce se trouve (Blondel, 1979). Pour les animaux terrestres, l’habitat peut également être défini par un ensemble de variables environnementales souvent équivalent à la communauté, à l’association végétale ou au type de recouvrement (Boitani & Fuller, 2000).

Certaines espèces animales n’occupent pas l’ensemble de leur aire potentielle bien qu’elles puissent se déplacer dans cet espace inoccupé (Krebs, 1994). Ces individus “ choisissent ” de ne pas vivre dans certains habitats et la distribution d’une espèce semble alors limitée par le comportement des individus à sélectionner leur habitat (Ibidem). La sélection de l’habitat est un des processus écologiques les moins bien compris (Ibidem).

La préférence d’habitat pour une espèce animale lui confère une haute “ fitness ” supportant ainsi une densité importante et équilibrée, en l’absence entre autre de compétition (Boitani & Fuller, 2000). Ainsi, l’espèce entreprend un processus de sélection de la ressource aboutissant à son utilisation. L’ensemble de ce mécanisme peut être résumé par le schéma suivant.

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 


Concernant les Amphibiens, le schéma se complique parce qu’ils occupent différents habitats durant leur cycle biologique : de reproduction, de vie terrestre et de transferts entre les deux précédents. L’ensemble de ces habitats forme une mosaïque d’écosystèmes que nous appelons le “paysage”. Le paysage est un niveau d’organisation des systèmes écologiques supérieur à l’écosystème qui se caractérise par son hétérogénéité et par sa dynamique gouvernée pour partie par les activités humaines (Burel & Baudry, 1999).

La dépendance des Amphibiens au milieu aquatique durant la période de reproduction et la meilleur “capturabilité” qui en résulte font que les recherches ont été focalisées autour ou à proximité immédiate de ces sites (Duellman & Trueb, 1994). Par opposition, la vie des Amphibiens en dehors de la période de reproduction est peu connue (Dodd, 1996).

Les Amphibiens sont en déclin parce que leurs paysages changent, parfois simplement par perte de leur habitat, mais le plus souvent en raison de l’altération de l’utilisation du paysage (Beebee, 1996). La gestion et la restauration des habitats des Amphibiens est la condition sine qua non pour préserver et faire prospérer les populations (Ibidem).

Fort de ces constats, sur la réserve naturelle du Marais d’Yves, nous avons évalué la préférence d’habitat du Pélobate cultripède par sa distribution spatiale en fonction des différents groupements de végétaux.

 

 

HABITAT AQUATIQUE DE LA POPULATION DE PÉLOBATE CUTRIPÈDE DE LA RÉSERVE NATURELLE DU MARAIS D’YVES

 

Chez les Amphibiens, les suivis d’espèce concernent principalement la biologie de la reproduction (Cfr par ex. Duellman & Trueb, 1994). Les études portant sur la reproduction du Pélobate cultripède s’intéressent tout particulièrement aux caractéristiques biologiques. En France, les suivis de la biologie de la reproduction du Pélobate cultripède ont été effectués dans différentes régions, des dunes littorales de Loire-Atlantique (Girard, 1989) aux dunes littorales de l’Hérault (Salvidio & Quero, 1987 ; Crespin, 1991).

Dans la péninsule Ibérique les travaux concernant la reproduction du Pélobate cultripède traitent également des aspects biologiques de la reproduction, développement des têtards (Alvarez et al., 1990 ; Busack & Zug, 1976), période de reproduction (Diaz-Paniagua, 1986 ; Domenech, 1994), régime alimentaire des larves (Diaz-Paniagua, 1985), ségrégation temporelle des peuplements de têtards (Diaz-Paniagua, 1988), de l’osmorégulation des adultes (Viegas et al., 1984) ainsi que des caractéristiques de la population des reproducteurs (Salvador et al., 1986 ; Lizana et al., 1994).

Peu d’études ont été effectuées sur les caractéristiques de l’habitat de reproduction des populations de Pélobate cultripède. En France, seul un suivi a été réalisé dans l’Hérault à la réserve naturelle de Roquehaute (Dohogne, 1999) et pour l’Espagne nous connaissons seulement l’étude de Diaz-Paniagua (1982) qui porte sur les facteurs déterminant l’habitat de reproduction du Pélobate dans le parc national de Doñana (Andalousie).

Cependant, la détermination des facteurs qui caractérisent les habitats de reproduction utilisés par le Pélobate cultripède est d’un intérêt majeur pour la mis en place d’opérations de gestion.

C’est pour cette raison que nous avons mis en place un suivi des caractéristiques des habitats de reproduction de la population de Pélobate cultripède de la réserve naturelle du Marais d’Yves. Ce suivi a permis de connaître quelques aspects physico-chimiques et quelques facteurs biologiques propres à ces sites de reproduction.

 

 


GESTION CONSERVATOIRE DE LA POPULATION DE PÉLOBATE CULTRIPÈDE DE LA RÉSERVE NATURELLE DU MARAIS D’YVES

 

Sur la façade atlantique française, l’urbanisation croissante du littoral et la mise en culture des zones humides ont entraîné la disparition partielle des habitats favorables au Pélobate cultripède. Le littoral français dans son ensemble, long de 5 500 km est urbanisé sur près de la moitié de sa longueur. La densité humaine y est en permanence égale à trois fois la moyenne nationale et neuf fois durant l’été (Morand-Deviller, 1987). En 30 ans, au niveau national, les zones humides ont perdu près de la moitié de leur superficie, qui ne représente plus aujourd’hui que 1,5 millions d’hectares, soit 3% du territoire (source internet du site du Ministère de l’Écologie et du Développement Durable).

Cette disparition massive d’habitats et des corridors qui les reliaient a entraîné une fragmentation des populations de Pélobates cultripèdes dont certaines sont maintenant totalement isolées : phénomène d’insularisation, dont la réserve naturelle du Marais d’Yves constitue un bon exemple.

Le maintient des populations de Pélobates cultripèdes passe par la mise en place d’une gestion conservatoire de l’espèce. Cependant jusqu’à un passé récent, la gestion concernant les Amphibiens ne prenait essentiellement en compte que les habitats de reproduction (Gent & Gibson, 1998). On sait maintenant que la gestion des habitats pour des populations insularisées ou en réseau (métapopulation) ne doit pas traiter séparément les éléments aquatiques et terrestres mais doit être intégrée (Ibidem).

Fort de ce constat, nous avons mis en place des propositions de gestion conservatoire pour la population de la réserve naturelle du Marais d’Yves.

 

 

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